太医院：

主官

- 院使：一人，正五品，负责考察院属各科医务官员的业务才能，并率御医、吏目、医士等为帝后、王公大臣等治疗疾病。

- 院判：二人，正六品，佐院使掌院务。

属官

- 御医：最初四人，后增至十八人，隆庆五年最终确定为十人，正八品，各精一科，专为皇帝、后妃等治疗疾病。

- 吏目：一人，从九品，隆庆五年定设十人。

其他机构

- 生药库：设大使、副大使各一人，未入流，负责掌管药物。

- 惠民药局：设大使、副使各一人，未入流，主要为贫苦百姓提供医疗服务。

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洪武朝翰林院，洪武十八年（1385年）更定后：

主官

- 翰林学士：一人，正五品。

学士类

- 侍读学士、侍讲学士：各二人，从五品。

讲读类

- 侍读、侍讲：各二人，正六品。

其他文职类

- 五经博士：九人，正八品，且职位世袭。

- 典籍：二人，从八品。

- 侍书：二人，正九品。

- 待诏：六人，从九品。

- 孔目：一人，未入流。

史官类

- 修撰：三人，从六品。

- 编修：四人，正七品。

- 检讨：四人，从七品。

储备人才类

- 庶吉士：员额不定，无品级。

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国子监：

主官

- 祭酒：一人，从四品，掌国学诸生训导之政令等。

- 司业：一人，正六品，协助祭酒总理太学政事等。

绳愆厅

- 监丞：一人，正八品，负责监督并执行监规，纠正师生过失。

博士厅

- 五经博士：五人，从八品，分别讲授《易》《诗》《书》《春秋》《礼记》，同时兼习《大学》《中庸》《论语》《孟子》，并负责按时考核学生的学习进度。

六堂

- 助教：每堂十五人，从八品，负责各堂的教学与训导。

- 学正：每堂十人，正九品，掌执行学规，考校训导。

- 学录：每堂七人，从九品。

典簿厅

- 典簿：一人，从八品，负责管理文书、财务等事务。

- 典籍：一人，从九品。

掌馔厅

- 掌馔：二人，未入流，负责饮食安排。

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五军都督府:指中军，左军，右军，前军，后军。

都督府主官

- 左、右都督：正一品。

- 都督同知：从一品。

- 都督佥事：正二品。

经历司

- 经历：从五品。