为了让人类的孩子更好地和数码宝贝配合，他们根据恒常性扫描到的孩子们的数据资料研发出了配套的神圣计划和徽章。

用一个名为大和田类的孩子在安全的人类世界作为试验，他们获得了更多的实验数据，以此更好校准了神圣计划和徽章的设置。

在这之后，第一代被选召的孩子们在恒常性的选召（绑架）下就这样来到了数码世界，并且与很久以前追随黄龙兽管理数码世界的四圣兽转世缔结了搭档关系。

在发育一段时间后，黑暗四天王终于发现了恒常性的计划以及人类孩子和数码宝贝搭档恐怖的潜力和对启示录兽力量的克制性，在第一代五人还没有一只究极体的时候动手围攻。

但危急时刻，恒常性利用神圣计划强行激发了四对搭档的力量，使得不完全进化的四圣兽重新现世，以永久牺牲其中一位孩子的数码宝贝搭档为代价，消灭了黑暗四天王之中的钢铁海龙兽和木偶兽，重创了无限龙兽和小丑皇。

数码世界在新一任四圣兽的管理下和平了一小段时间，不过恒常性和玄内他们都清楚，黑暗四天王总会再次归来，以最初拟定的那份被选召名单，数据人们再次忙碌起来。

但是这次并没有那么好运，重新恢复的黑暗四天王借助启示录兽的力量与四圣兽在数码世界里再度开战，谁也没有想到在那种紧张的时候，小丑皇还会去攻击研究神圣计划和徽章的地方。

在小丑皇的突然袭击下，所有的数据人只有玄内被小丑皇植入黑暗数据后苟活了下来，保住了除了代表光明的孩子以外的所有数码蛋、神圣计划和配套的徽章，之后长期的战火波及到了数码世界的大部分地方，一直到现在……

从众多不起眼的数据人成为了被选召的孩子的引路人，由青年模样转变成了老年模样的玄内看着已经前去休息的孩子们，眼里透露出一丝怀念和对未来的憧憬。

黑暗已经归来，平衡与安定已经被打破，数码世界也已经不再和平——不过不用担心，因为新的希望已经再度降临……