在大宋江南的一个小镇，夜幕低垂之时，灯火阑珊，街头巷尾散发着香味的茶楼与酒肆，熙熙攘攘。人们都在尽情享受这轻松愉快的时刻，然而此时此刻，却有人正面临着无尽的痛苦与绝望。
一个名叫李牡丹的年轻女子，此时正蜷缩在狭小阴暗的小巷中，满脸惊恐。她的身材纤细，皮肤如玉，五官精致。然而此刻，她的脸上却写满了悲伤。就在昨日夜里，她的父亲被神秘人杀害，而她也在惊恐中逃脱，被迫流落街头。此夜，她心中充满了不安，暗暗发誓要为父报仇。
正当李牡丹神思恍惚之际，镇上的护卫队长丁发荣突然闯入巷中，吓得她连忙退到墙角。丁发荣一把抓住她的肩膀，沉声道：“姑娘，你有什么事情吗？为何在此处逗留。”李牡丹颤声道：“我……我父亲他被人杀了！我得找人调查……”
此时，包拯正在县衙中审问案犯，他隐约听闻这个案件，便决定亲自前往调查。包拯身材魁梧，眉目如剑，神情严肃，走出衙门，召集了得力助手展昭与师爷公孙述。展昭身材修长，英俊潇洒，一脸正气，常伴于包拯左右，公孙述则略显肥胖，精明能干，嘴角常带微笑，是个好出主意的谋士。
包拯对他们道：“此案牵涉较深，必须快些查出真相。展昭，你去探查李牡丹的身世，公孙述，陪我去见县令，看看有没有关于此案的线索。”说罢，几人便各自分头行事。
几天后的一个深夜，包拯与展昭接到李牡丹的求助，前往她家中探查。整个庭院笼罩在月光下，显得格外阴森。李牡丹迎接众人，脸色苍白，神情恍惚，似乎全身无力，只是用微弱的声音讲述她父亲生前的事情。李牡丹的父亲李大成是村中小有名气的医生，平日行医救人，为人和蔼。可最近却接二连三地得罪了几位当地富商，因为他们的病都在他手中无法医治。想必正是因此得来的杀身之祸。
李牡丹低声说道：“父亲临死前说有人在暗中使坏，他曾为一名病重的东洋商人诊脉，却发现了他身上藏有异物。父亲怀疑这可能与东洋邪术有关。”包拯心中一动，问道：“你父亲有何证据？”李牡丹指了指甘蔗架上的一卷卷宗，继续道：“他在临死前留下了一本药方，上面提及一种奇异的草药，名为‘暗香草’，用以调配一种致命的毒药。”
包拯接过药方，眉头紧锁。“这暗香草果然镜中有影，若可法用，必能令生者中毒，而复生者则不可自知。但为何这药方中没有提及东洋商人的身份？”
李牡丹道：“我父亲在临死前曾提及，有一个东洋人总在暗中观察，或许与此案有关。而他之所以不明说，或许是为了保护我……”话音未落，她一阵抽泣，展昭轻轻拍拍她的肩膀，试图安慰她，但包拯却陷入了沉思。
第二天，包拯带着公孙述和展昭来到了镇中最大的客栈，正好遇见了那名东洋商人。东洋商人肤色浅，长发飘逸，身着独特的服装，显得十分不同寻常。包拯直言不讳，“我怀疑与昨天李老医的死有关，请你如实作答。”
东洋商人脸上的微笑瞬间收敛，冷冷地道：“我与李掌柜之间并无深交，若说有恩怨，便是他一直揽贩我的药材，意图抬高价格。”包拯见他神态轻松、含义莫测，心中更加警觉，转而询问“暗香草”的来源，东洋人支支吾吾，却始终不肯透露。
会后，包拯决定跟随商人，寻求真相。经过一夜的跟踪，他发现东洋商人竟然秘密会见一家药铺的老板，交易了几种神秘药材。药铺老板惯常隐秘，但在包拯的威逼下，终究交代了其中的秘密。
200多年前，东洋部落崇尚巫蛊术，常将暗香草与其他草药相配，制造出能够让人心智崩溃的毒药，死后可进一步操控尸体。这种妖术在东洋极其罕见，但极其致命。既然李大成尝试反抗，必遭其杀。
包拯未曾泄露任何情绪，暗中将此发现告知展昭与公孙述。三人商量后决定，设下一计，诱东洋商人自投罗网。于是，包拯假装送检案情，伪造了一封手书信，声称有重要药材购买的合作机会，以此引诱他前来偷盗证据。随后，展昭与公孙述暗中埋伏在药铺周围，静待东洋商人出现。
终于，东洋商人中计，夜深时分窜入药铺，正要取走包裹之际，展昭与公孙述同时冲出，强行制住他。经过审问，东洋商人终于承认他的确与李大成的死亡有间接关系，因为他购买了药方，并试图进行日常交易，没想到却引起了李老医的怀疑，才动手杀了人。
然而，东洋商人答应供出幕后黑手之时，却被突然闯入的另一名似乎是黑衣人所暗算。黑衣人剑法奇快，展昭与公孙述及包拯一时难以招架。包拯心生疑惑，暗想难道还有其他势力在暗中作梗？
经过一场剧烈的搏斗，包拯凭借智慧与勇气成功击退了黑衣人。在东洋商人的帮助下，揭开了黑衣人的真面目，竟然是当地的一位官员，因贪图李大成的医术而心生不满，利用东洋商人进行阴谋，更毁了无辜的李牡丹。
真相浮出水面，东洋商人虽有罪但通过正义力量收拾，但在包拯法庭上也为解救李牡丹而悔改流泪，包拯将他宣判流放。李牡丹惶恐而后又欣喜，不知自己是否应再相信这个世界。包拯叹息，抬头看天，知道人生都是充满变数，然而正义与良知永存。
最后，包拯将李牡丹送往亲属门下，留下一个安稳的未来。他暗想，世间有妖术邪曲，却不敌公正之心。此案虽扑朔迷离，却最终得以真相大白，百姓归宁。共勉维梧桐林长青，而我辈正气不屈。正因如此，才有今日之昭告，人因公义而存，有义气而生。
包拯默默地走入更深的夜色，似乎映在那柔和的月光中，期待下一个会出现的奇案。至此，一个新的篇章又将开启。